Što se događa kad se dvoje ljudi vole, ali im jednostavno nije suđeno? Takaki Toono i Akari Shinohara prijatelji su iz djetinjstva, ali okolnosti izvan njihove kontrole razdvajaju ih. Obećavaju da će ostati u kontaktu i premda napredovanje vremena povećava udaljenost između njih, lanac sjećanja ostaje uvijek prisutan.
Byousoku 5 Centimeter romantična je drama koja se fokusira na svakodnevnu i surovu stvarnost odnosa na daljinu. Zapeli u prošlosti i nesposobni za stvaranje novih uspomena, Takaki i Akari drže se nade da će se ponovno vidjeti. Oni svakodnevnicu žive polovično, povrijeđujući i sebe i ljude oko sebe.