U sve većem svijetu Dvostrukih čudovišta, dok dvobojaci poboljšavaju svoje vještine i podižu redove, dvoboji postaju sve složeniji. Pridržavajući se strogih pravila, uz korištenje i učenje provjerenih strategija, može se razviti u snažni dvoboj. Međutim, kao dječak koji voli izume i otkriva nove mogućnosti, učenici osnovne škole Yuuga Oudou trenutni je način dvoboja predvidljiv i krut – drugim riječima, dosadan.
Stoga mu je cilj stvoriti novi put u dvobojima sa svojim uzbudljivim novim izumom: Rush Duels. Njegova ambicija ubrzo privlači pozornost Tatsuhise Kamijou, kolege iz osnovne škole, koja ga dovodi na misteriozno mjesto u pokušaju da otkrije potencijal novog sustava.
Iako Yuuga želi primijeniti Rush Duels kao novi standard dvoboja i srušiti konvencije igre, on otvara vrata svom konačnom cilju – učiniti dvoboj opet uzbudljivim.
